Федеральное государственное бюджетное учреждение (краткое название ФГБУ «Шорский национальный парк» в соответствии с распоряжением Правительства Российской Федерации от 31 декабря 2008 года №2056-р (Собрание законодательства Российской Федерации, 2009 №2 ст.336) находится в ведении Министерства Природных ресурсов и экологии Российской Федерации (Минприроды России).
Учредителем Учреждения является Правительство Российской Федерации. Полномочия учредителя Учреждения от имени Российской Федерации осуществляет федеральный орган исполнительной власти – Министерство природных ресурсов Р Ф. http://www.mnr.gov.ru/
Учреждение руководствуется в своей деятельности Конституцией Российской Федерации, федеральными конституционными законами, указами и распоряжениями президента Российской Федерации, постановлениями и распоряжениями Правительства Российской Федерации, иными нормативными правовыми актами Российской Федерации, в том числе нормативными актами Минприроды России, законодательством Кемеровской области- Кузбасса и Уставом Учреждения.
Управление Учреждением осуществляется в соответствии с законодательством Российской Федерации и Уставом учреждения. Директор Учреждения руководит деятельностью ФГБУ «Шорский национальный парк» и действует в соответствии с Уставом.
Сегодня парку исполнилось 32 год со дня создания. Решение о создании национального природного парка, утверждено постановлением Совета Министров РСФСР №386 от 27.12.1989 г.
Коллектив ФГБУ «Шорский национальный парк» состоит из профессиональных сотрудников. В парке трудятся работники, которые начали работать почти с первых дней основания национального парка, также есть молодые сотрудники, которые начинают свою деятельность в природоохранной сфере.